| 1e Ronde | 14.09.2006 | FC Basel 1893 | - | FK Rabotnički | 6:2 | ||||
| 1e Ronde | 28.09.2006 | FK Rabotnički | - | FC Basel 1893 | 0:1 |  |
|||
| Groep E | 19.10.2006 | FC Basel 1893 | - | Feyenoord | 1:1 | ||||
| Groep E | 02.11.2006 | Blackburn Rovers | - | FC Basel 1893 | 3:0 | ||||
| Groep E | 23.11.2006 | FC Basel 1893 | - | AS Nancy Lorraine | 2:2 | |
|||
| Groep E | 30.11.2006 | Wisła Kraków | - | FC Basel 1893 | 3:1 |  |
Australië
Noord-Macedonië