| 1. Ronde | 31.07.2016 | Bohemians Praha 1905 | - | FC Hradec Králové | 0:3 | ||||
| 2. Ronde | 06.08.2016 | FC Hradec Králové | - | FK Jablonec | 1:2 | ||||
| 3. Ronde | 14.08.2016 | FK Dukla Praha | - | FC Hradec Králové | 3:0 | ||||
| 4. Ronde | 20.08.2016 | FC Hradec Králové | - | Vysočina Jihlava | 1:0 |  |
|||
| 5. Ronde | 26.08.2016 | FK Mladá Boleslav | - | FC Hradec Králové | 2:0 | ||||
| 6. Ronde | 10.09.2016 | FC Hradec Králové | - | 1. FK Příbram | 2:0 | ||||
| 7. Ronde | 17.09.2016 | Zbrojovka Brno | - | FC Hradec Králové | 1:1 | ||||
| 8. Ronde | 24.09.2016 | FC Hradec Králové | - | FC Fastav Zlín | 0:2 | ||||
| 9. Ronde | 02.10.2016 | Viktoria Plzeň | - | FC Hradec Králové | 4:1 | ||||
| 10. Ronde | 15.10.2016 | FC Hradec Králové | - | Slavia Praag | 0:3 |  |
|||
| 11. Ronde | 23.10.2016 | Slovan Liberec | - | FC Hradec Králové | 2:0 | ||||
| 12. Ronde | 30.10.2016 | FC Hradec Králové | - | MFK Karviná | 3:4 | ||||
| 13. Ronde | 05.11.2016 | FK Teplice | - | FC Hradec Králové | 0:1 | |
|||
| 14. Ronde | 19.11.2016 | 1. FC Slovácko | - | FC Hradec Králové | 1:3 | ||||
| 15. Ronde | 27.11.2016 | FC Hradec Králové | - | Sparta Praag | 1:2 |
Tsjechië